长期未经治疗的各种贫血、慢性肾功能衰竭、垂体前叶及甲状腺机能减退症、免疫因素、遗传因素均能引起再障，部分阵发性睡眠性血红蛋白尿症（PNH）也可转化为再障，称“AA-PNH综合征”。少数女性再障，在妊娠期发病，分娩后缓解，第二次妊娠复发。遗传病如综合征、先天性角质分化不良等，由于DNA的修复障碍，或免疫缺损，易伴发再障。
(1)药物因素
①剂量过大或长期使用肯定引起再障的药物有：
化学毒物：如苯及衍生物甲苯等；
抗肿瘤(细胞毒类)药物，如6-巯基嘌呤、马利兰、米法兰、长春新碱、环磷酰胺、氨甲喋呤等；
其他毒性药物，如无机砷等。
②偶可引起再障的药物：
抗生素：如氯霉素、合霉素、青霉素类、四环素、有机砷类、链霉素、两性霉素B、卡那霉素、土霉素、磺胺、磺胺异口恶唑；
抗惊厥药：美散痛、三甲双酮、苯妥英钠、扑痫酮；
解热镇痛药：保泰松、阿斯匹林、扑热息痛；
抗甲状腺药：甲亢平、他巴唑；
降血糖药：甲苯磺丁脲、氯磺丙脲；
精神安定药：冬眠灵、利眠宁；
杀虫药：DDT等；
抗疟药：阿的平、氯喹；
利尿剂：醋氮酰胺。
近年来，研究者注意到速效感冒胶囊与再障病因的关系。发现多位再障患者在患病前有多次服速效感冒胶囊的历史，有的病人因常服该药而患急性再障。速效感冒胶囊成分之一是扑热息痛，可能是致病的原因。
(2)电离辐射
电离辐射如X线、放射性同位素等可以进入细胞，破坏DNA和蛋白质，以致细胞破坏，骨髓细胞对电离辐射尤为敏感，其中红系细胞最敏感，粒系细胞次之，再次为巨核细胞系，对淋巴细胞也有溶解作用。电离辐射是再障病因之一，早已为广大学者所认识。
(3)生物因素
虽然病毒、细菌、寄生虫都可引起再障，值得提出的是病毒性肝炎后再障，多在肝炎发病期间至1年以后出现，与肝炎轻重无关，病死率高。肝炎引起再障的机理，有的认为肝炎病毒对造血干细胞有直接作用，或用免疫机理解释。也有人认为从胚胎发生学上看，肝与骨髓均属于单核?巨噬细胞系统，因此一种抑制因子与肝、骨髓可能有交叉作用。

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